Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NMRK1Q9NWW6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK1Q9NWW6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NMRK1Q9NWW6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NMRK1Q9NWW6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NMRK1Q9NWW6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NMRK1Q9NWW6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NMRK1Q9NWW6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NMRK1Q9NWW6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NMRK1Q9NWW6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NMRK1Q9NWW6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NMRK1Q9NWW6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NMRK1Q9NWW6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NMRK1Q9NWW6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NMRK1Q9NWW6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NMRK1Q9NWW6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NMRK1Q9NWW6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NMRK1Q9NWW6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NMRK1Q9NWW6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMRK1Q9NWW6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMRK1Q9NWW6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NMRK1Q9NWW6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NMRK1Q9NWW6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NMRK1Q9NWW6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NMRK1Q9NWW6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NMRK1Q9NWW6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NMRK1Q9NWW6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NMRK1Q9NWW6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NMRK1Q9NWW6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NMRK1Q9NWW6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NMRK1Q9NWW6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NMRK1Q9NWW6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NMRK1Q9NWW6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NMRK1Q9NWW6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NMRK1Q9NWW6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NMRK1Q9NWW6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NMRK1Q9NWW6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NMRK1Q9NWW6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NMRK1Q9NWW6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NMRK1Q9NWW6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NMRK1Q9NWW6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NMRK1Q9NWW6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NMRK1Q9NWW6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NMRK1Q9NWW6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms