Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATAD3AQ9NVI7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATAD3AQ9NVI7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATAD3AQ9NVI7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATAD3AQ9NVI7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD3AQ9NVI7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD3AQ9NVI7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD3AQ9NVI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD3AQ9NVI7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATAD3AQ9NVI7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATAD3AQ9NVI7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATAD3AQ9NVI7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATAD3AQ9NVI7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATAD3AQ9NVI7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATAD3AQ9NVI7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATAD3AQ9NVI7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATAD3AQ9NVI7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATAD3AQ9NVI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATAD3AQ9NVI7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATAD3AQ9NVI7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAD3AQ9NVI7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAD3AQ9NVI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATAD3AQ9NVI7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAD3AQ9NVI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAD3AQ9NVI7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAD3AQ9NVI7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATAD3AQ9NVI7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATAD3AQ9NVI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms