Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCFQ9NPI8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCFQ9NPI8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCFQ9NPI8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCFQ9NPI8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCFQ9NPI8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCFQ9NPI8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCFQ9NPI8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCFQ9NPI8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCFQ9NPI8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCFQ9NPI8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCFQ9NPI8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCFQ9NPI8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCFQ9NPI8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCFQ9NPI8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCFQ9NPI8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCFQ9NPI8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCFQ9NPI8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FANCFQ9NPI8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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