Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PREBQ9HCU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PREBQ9HCU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PREBQ9HCU5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PREBQ9HCU5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PREBQ9HCU5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PREBQ9HCU5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PREBQ9HCU5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PREBQ9HCU5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PREBQ9HCU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PREBQ9HCU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PREBQ9HCU5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PREBQ9HCU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PREBQ9HCU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PREBQ9HCU5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PREBQ9HCU5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PREBQ9HCU5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PREBQ9HCU5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PREBQ9HCU5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREBQ9HCU5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREBQ9HCU5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREBQ9HCU5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREBQ9HCU5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREBQ9HCU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PREBQ9HCU5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PREBQ9HCU5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PREBQ9HCU5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PREBQ9HCU5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PREBQ9HCU5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PREBQ9HCU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREBQ9HCU5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREBQ9HCU5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREBQ9HCU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREBQ9HCU5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREBQ9HCU5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREBQ9HCU5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PREBQ9HCU5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREBQ9HCU5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREBQ9HCU5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREBQ9HCU5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREBQ9HCU5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREBQ9HCU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREBQ9HCU5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREBQ9HCU5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREBQ9HCU5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREBQ9HCU5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PREBQ9HCU5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PREBQ9HCU5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PREBQ9HCU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREBQ9HCU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PREBQ9HCU5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PREBQ9HCU5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PREBQ9HCU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PREBQ9HCU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREBQ9HCU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms