Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LY9Q9HBG7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LY9Q9HBG7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LY9Q9HBG7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LY9Q9HBG7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
LY9Q9HBG7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LY9Q9HBG7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LY9Q9HBG7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LY9Q9HBG7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LY9Q9HBG7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LY9Q9HBG7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LY9Q9HBG7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LY9Q9HBG7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LY9Q9HBG7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LY9Q9HBG7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LY9Q9HBG7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LY9Q9HBG7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
LY9Q9HBG7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LY9Q9HBG7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LY9Q9HBG7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LY9Q9HBG7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LY9Q9HBG7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
LY9Q9HBG7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LY9Q9HBG7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LY9Q9HBG7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LY9Q9HBG7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LY9Q9HBG7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LY9Q9HBG7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LY9Q9HBG7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LY9Q9HBG7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LY9Q9HBG7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LY9Q9HBG7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LY9Q9HBG7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LY9Q9HBG7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LY9Q9HBG7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LY9Q9HBG7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LY9Q9HBG7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LY9Q9HBG7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LY9Q9HBG7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LY9Q9HBG7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LY9Q9HBG7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms