Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RSPH6AQ9H0K4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RSPH6AQ9H0K4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RSPH6AQ9H0K4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RSPH6AQ9H0K4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RSPH6AQ9H0K4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSPH6AQ9H0K4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSPH6AQ9H0K4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSPH6AQ9H0K4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RSPH6AQ9H0K4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH6AQ9H0K4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RSPH6AQ9H0K4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RSPH6AQ9H0K4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
RSPH6AQ9H0K4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RSPH6AQ9H0K4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RSPH6AQ9H0K4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSPH6AQ9H0K4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH6AQ9H0K4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH6AQ9H0K4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH6AQ9H0K4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RSPH6AQ9H0K4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RSPH6AQ9H0K4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSPH6AQ9H0K4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSPH6AQ9H0K4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH6AQ9H0K4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH6AQ9H0K4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RSPH6AQ9H0K4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RSPH6AQ9H0K4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RSPH6AQ9H0K4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSPH6AQ9H0K4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSPH6AQ9H0K4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSPH6AQ9H0K4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSPH6AQ9H0K4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH6AQ9H0K4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH6AQ9H0K4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH6AQ9H0K4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH6AQ9H0K4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH6AQ9H0K4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH6AQ9H0K4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH6AQ9H0K4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RSPH6AQ9H0K4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RSPH6AQ9H0K4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RSPH6AQ9H0K4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RSPH6AQ9H0K4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RSPH6AQ9H0K4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RSPH6AQ9H0K4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RSPH6AQ9H0K4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RSPH6AQ9H0K4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSPH6AQ9H0K4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSPH6AQ9H0K4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSPH6AQ9H0K4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RSPH6AQ9H0K4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RSPH6AQ9H0K4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RSPH6AQ9H0K4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RSPH6AQ9H0K4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RSPH6AQ9H0K4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSPH6AQ9H0K4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RSPH6AQ9H0K4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms