Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL25Q9H0H3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL25Q9H0H3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL25Q9H0H3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL25Q9H0H3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL25Q9H0H3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL25Q9H0H3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL25Q9H0H3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL25Q9H0H3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL25Q9H0H3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHL25Q9H0H3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL25Q9H0H3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL25Q9H0H3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL25Q9H0H3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL25Q9H0H3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL25Q9H0H3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLHL25Q9H0H3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL25Q9H0H3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL25Q9H0H3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL25Q9H0H3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL25Q9H0H3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL25Q9H0H3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL25Q9H0H3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL25Q9H0H3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL25Q9H0H3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL25Q9H0H3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL25Q9H0H3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL25Q9H0H3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL25Q9H0H3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL25Q9H0H3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL25Q9H0H3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL25Q9H0H3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL25Q9H0H3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL25Q9H0H3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL25Q9H0H3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL25Q9H0H3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL25Q9H0H3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL25Q9H0H3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL25Q9H0H3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL25Q9H0H3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL25Q9H0H3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL25Q9H0H3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms