Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
THSD7BQ9C0I4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
THSD7BQ9C0I4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
THSD7BQ9C0I4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
THSD7BQ9C0I4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
THSD7BQ9C0I4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
THSD7BQ9C0I4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
THSD7BQ9C0I4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
THSD7BQ9C0I4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
THSD7BQ9C0I4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
THSD7BQ9C0I4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
THSD7BQ9C0I4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7BQ9C0I4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
THSD7BQ9C0I4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
THSD7BQ9C0I4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
THSD7BQ9C0I4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
THSD7BQ9C0I4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
THSD7BQ9C0I4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
THSD7BQ9C0I4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
THSD7BQ9C0I4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
THSD7BQ9C0I4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
THSD7BQ9C0I4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
THSD7BQ9C0I4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7BQ9C0I4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
THSD7BQ9C0I4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
THSD7BQ9C0I4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
THSD7BQ9C0I4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7BQ9C0I4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7BQ9C0I4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
THSD7BQ9C0I4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
THSD7BQ9C0I4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
THSD7BQ9C0I4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
THSD7BQ9C0I4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
THSD7BQ9C0I4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
THSD7BQ9C0I4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
THSD7BQ9C0I4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
THSD7BQ9C0I4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7BQ9C0I4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
THSD7BQ9C0I4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
THSD7BQ9C0I4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
THSD7BQ9C0I4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
THSD7BQ9C0I4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
THSD7BQ9C0I4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
THSD7BQ9C0I4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
THSD7BQ9C0I4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
THSD7BQ9C0I4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
THSD7BQ9C0I4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
THSD7BQ9C0I4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
THSD7BQ9C0I4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
THSD7BQ9C0I4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
THSD7BQ9C0I4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
THSD7BQ9C0I4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
THSD7BQ9C0I4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
THSD7BQ9C0I4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
THSD7BQ9C0I4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
THSD7BQ9C0I4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
THSD7BQ9C0I4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
THSD7BQ9C0I4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
THSD7BQ9C0I4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
THSD7BQ9C0I4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
THSD7BQ9C0I4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
THSD7BQ9C0I4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
THSD7BQ9C0I4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
THSD7BQ9C0I4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
THSD7BQ9C0I4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
THSD7BQ9C0I4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
THSD7BQ9C0I4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
THSD7BQ9C0I4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
THSD7BQ9C0I4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
THSD7BQ9C0I4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms