Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMBRA1Q9C0C7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMBRA1Q9C0C7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMBRA1Q9C0C7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AMBRA1Q9C0C7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMBRA1Q9C0C7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMBRA1Q9C0C7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMBRA1Q9C0C7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMBRA1Q9C0C7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMBRA1Q9C0C7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMBRA1Q9C0C7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMBRA1Q9C0C7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMBRA1Q9C0C7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMBRA1Q9C0C7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMBRA1Q9C0C7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMBRA1Q9C0C7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMBRA1Q9C0C7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMBRA1Q9C0C7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AMBRA1Q9C0C7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMBRA1Q9C0C7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMBRA1Q9C0C7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMBRA1Q9C0C7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMBRA1Q9C0C7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMBRA1Q9C0C7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMBRA1Q9C0C7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMBRA1Q9C0C7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMBRA1Q9C0C7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AMBRA1Q9C0C7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AMBRA1Q9C0C7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMBRA1Q9C0C7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMBRA1Q9C0C7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AMBRA1Q9C0C7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMBRA1Q9C0C7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMBRA1Q9C0C7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMBRA1Q9C0C7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMBRA1Q9C0C7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms