Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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