Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFXN3Q9BWM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFXN3Q9BWM7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFXN3Q9BWM7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFXN3Q9BWM7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFXN3Q9BWM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFXN3Q9BWM7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFXN3Q9BWM7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SFXN3Q9BWM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFXN3Q9BWM7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN3Q9BWM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN3Q9BWM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFXN3Q9BWM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFXN3Q9BWM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFXN3Q9BWM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFXN3Q9BWM7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFXN3Q9BWM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFXN3Q9BWM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFXN3Q9BWM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN3Q9BWM7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SFXN3Q9BWM7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFXN3Q9BWM7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFXN3Q9BWM7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN3Q9BWM7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFXN3Q9BWM7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFXN3Q9BWM7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN3Q9BWM7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFXN3Q9BWM7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFXN3Q9BWM7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFXN3Q9BWM7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms