Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP8Q9BV40 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP8Q9BV40 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP8Q9BV40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP8Q9BV40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP8Q9BV40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAMP8Q9BV40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP8Q9BV40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP8Q9BV40 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP8Q9BV40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP8Q9BV40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP8Q9BV40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP8Q9BV40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP8Q9BV40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP8Q9BV40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP8Q9BV40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP8Q9BV40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP8Q9BV40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAMP8Q9BV40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP8Q9BV40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP8Q9BV40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms