Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NICN1Q9BSH3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NICN1Q9BSH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NICN1Q9BSH3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NICN1Q9BSH3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NICN1Q9BSH3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NICN1Q9BSH3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NICN1Q9BSH3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NICN1Q9BSH3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NICN1Q9BSH3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NICN1Q9BSH3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NICN1Q9BSH3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NICN1Q9BSH3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NICN1Q9BSH3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NICN1Q9BSH3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NICN1Q9BSH3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NICN1Q9BSH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NICN1Q9BSH3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NICN1Q9BSH3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NICN1Q9BSH3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NICN1Q9BSH3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NICN1Q9BSH3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms