Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLX1AQ9BQ83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLX1AQ9BQ83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLX1AQ9BQ83 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLX1AQ9BQ83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLX1AQ9BQ83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLX1AQ9BQ83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLX1AQ9BQ83 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLX1AQ9BQ83 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLX1AQ9BQ83 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLX1AQ9BQ83 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLX1AQ9BQ83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLX1AQ9BQ83 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLX1AQ9BQ83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLX1AQ9BQ83 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLX1AQ9BQ83 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLX1AQ9BQ83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLX1AQ9BQ83 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLX1AQ9BQ83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLX1AQ9BQ83 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLX1AQ9BQ83 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLX1AQ9BQ83 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLX1AQ9BQ83 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLX1AQ9BQ83 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLX1AQ9BQ83 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLX1AQ9BQ83 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLX1AQ9BQ83 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLX1AQ9BQ83 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLX1AQ9BQ83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLX1AQ9BQ83 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLX1AQ9BQ83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLX1AQ9BQ83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX1AQ9BQ83 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX1AQ9BQ83 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX1AQ9BQ83 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms