Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF6BQ99941 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF6BQ99941 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF6BQ99941 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF6BQ99941 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF6BQ99941 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF6BQ99941 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF6BQ99941 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF6BQ99941 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF6BQ99941 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF6BQ99941 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF6BQ99941 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF6BQ99941 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF6BQ99941 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF6BQ99941 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF6BQ99941 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF6BQ99941 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF6BQ99941 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6BQ99941 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF6BQ99941 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF6BQ99941 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6BQ99941 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF6BQ99941 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF6BQ99941 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6BQ99941 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF6BQ99941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF6BQ99941 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6BQ99941 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6BQ99941 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF6BQ99941 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6BQ99941 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6BQ99941 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms