Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPAS2Q99743 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPAS2Q99743 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPAS2Q99743 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPAS2Q99743 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPAS2Q99743 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPAS2Q99743 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NPAS2Q99743 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPAS2Q99743 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPAS2Q99743 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPAS2Q99743 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPAS2Q99743 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPAS2Q99743 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NPAS2Q99743 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPAS2Q99743 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPAS2Q99743 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPAS2Q99743 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPAS2Q99743 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPAS2Q99743 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPAS2Q99743 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NPAS2Q99743 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPAS2Q99743 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPAS2Q99743 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPAS2Q99743 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPAS2Q99743 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPAS2Q99743 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPAS2Q99743 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPAS2Q99743 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPAS2Q99743 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPAS2Q99743 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPAS2Q99743 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS2Q99743 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPAS2Q99743 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms