Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAD5Q99717 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD5Q99717 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD5Q99717 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD5Q99717 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD5Q99717 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD5Q99717 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD5Q99717 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD5Q99717 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD5Q99717 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD5Q99717 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD5Q99717 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD5Q99717 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD5Q99717 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD5Q99717 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD5Q99717 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD5Q99717 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD5Q99717 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD5Q99717 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD5Q99717 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD5Q99717 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD5Q99717 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD5Q99717 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD5Q99717 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD5Q99717 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD5Q99717 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD5Q99717 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD5Q99717 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD5Q99717 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD5Q99717 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD5Q99717 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD5Q99717 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD5Q99717 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD5Q99717 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD5Q99717 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD5Q99717 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD5Q99717 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD5Q99717 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD5Q99717 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD5Q99717 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD5Q99717 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD5Q99717 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD5Q99717 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD5Q99717 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms