Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PLEKHF1Q96S99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PLEKHF1Q96S99 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PLEKHF1Q96S99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PLEKHF1Q96S99 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PLEKHF1Q96S99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PLEKHF1Q96S99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PLEKHF1Q96S99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PLEKHF1Q96S99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PLEKHF1Q96S99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PLEKHF1Q96S99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PLEKHF1Q96S99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PLEKHF1Q96S99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PLEKHF1Q96S99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PLEKHF1Q96S99 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLEKHF1Q96S99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PLEKHF1Q96S99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PLEKHF1Q96S99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PLEKHF1Q96S99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PLEKHF1Q96S99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PLEKHF1Q96S99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PLEKHF1Q96S99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PLEKHF1Q96S99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PLEKHF1Q96S99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLEKHF1Q96S99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLEKHF1Q96S99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLEKHF1Q96S99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PLEKHF1Q96S99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PLEKHF1Q96S99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLEKHF1Q96S99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLEKHF1Q96S99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PLEKHF1Q96S99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PLEKHF1Q96S99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PLEKHF1Q96S99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PLEKHF1Q96S99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLEKHF1Q96S99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PLEKHF1Q96S99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLEKHF1Q96S99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLEKHF1Q96S99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PLEKHF1Q96S99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PLEKHF1Q96S99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PLEKHF1Q96S99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PLEKHF1Q96S99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PLEKHF1Q96S99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PLEKHF1Q96S99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PLEKHF1Q96S99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PLEKHF1Q96S99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PLEKHF1Q96S99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLEKHF1Q96S99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLEKHF1Q96S99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PLEKHF1Q96S99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PLEKHF1Q96S99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PLEKHF1Q96S99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PLEKHF1Q96S99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLEKHF1Q96S99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLEKHF1Q96S99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLEKHF1Q96S99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLEKHF1Q96S99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLEKHF1Q96S99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PLEKHF1Q96S99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PLEKHF1Q96S99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLEKHF1Q96S99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLEKHF1Q96S99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PLEKHF1Q96S99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PLEKHF1Q96S99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PLEKHF1Q96S99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLEKHF1Q96S99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PLEKHF1Q96S99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PLEKHF1Q96S99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PLEKHF1Q96S99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLEKHF1Q96S99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms