Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JMJD8Q96S16 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JMJD8Q96S16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
JMJD8Q96S16 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JMJD8Q96S16 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JMJD8Q96S16 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JMJD8Q96S16 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JMJD8Q96S16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
JMJD8Q96S16 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JMJD8Q96S16 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JMJD8Q96S16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JMJD8Q96S16 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JMJD8Q96S16 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JMJD8Q96S16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JMJD8Q96S16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JMJD8Q96S16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JMJD8Q96S16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JMJD8Q96S16 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JMJD8Q96S16 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JMJD8Q96S16 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JMJD8Q96S16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
JMJD8Q96S16 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JMJD8Q96S16 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JMJD8Q96S16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JMJD8Q96S16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms