Protein–RNA interactions for Protein: Q96S07

PRR25, Proline-rich protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR25Q96S07 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR25Q96S07 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR25Q96S07 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR25Q96S07 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR25Q96S07 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR25Q96S07 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR25Q96S07 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR25Q96S07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR25Q96S07 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR25Q96S07 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR25Q96S07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR25Q96S07 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR25Q96S07 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR25Q96S07 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR25Q96S07 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR25Q96S07 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR25Q96S07 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR25Q96S07 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR25Q96S07 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR25Q96S07 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRR25Q96S07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRR25Q96S07 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRR25Q96S07 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRR25Q96S07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRR25Q96S07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRR25Q96S07 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRR25Q96S07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRR25Q96S07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRR25Q96S07 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms