Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
IFT140Q96RY7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
IFT140Q96RY7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
IFT140Q96RY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.66■■■■■ 5.7
IFT140Q96RY7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
IFT140Q96RY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
IFT140Q96RY7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC50.59■■■■■ 5.69
IFT140Q96RY7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
IFT140Q96RY7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
IFT140Q96RY7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
IFT140Q96RY7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC50.3■■■■■ 5.64
IFT140Q96RY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC50.22■■■■■ 5.63
IFT140Q96RY7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
IFT140Q96RY7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
IFT140Q96RY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
IFT140Q96RY7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.08■■■■■ 5.61
IFT140Q96RY7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC50.08■■■■■ 5.61
IFT140Q96RY7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
IFT140Q96RY7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
IFT140Q96RY7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
IFT140Q96RY7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
IFT140Q96RY7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
IFT140Q96RY7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC49.91■■■■■ 5.58
IFT140Q96RY7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.9■■■■■ 5.58
IFT140Q96RY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
IFT140Q96RY7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
IFT140Q96RY7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
IFT140Q96RY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
IFT140Q96RY7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.74■■■■■ 5.55
IFT140Q96RY7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
IFT140Q96RY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC49.69■■■■■ 5.55
IFT140Q96RY7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
IFT140Q96RY7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
IFT140Q96RY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC49.63■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
IFT140Q96RY7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
IFT140Q96RY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
IFT140Q96RY7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
IFT140Q96RY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC49.4■■■■■ 5.5
IFT140Q96RY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC49.39■■■■■ 5.5
IFT140Q96RY7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.34■■■■■ 5.49
IFT140Q96RY7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
IFT140Q96RY7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
IFT140Q96RY7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
IFT140Q96RY7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC49.3■■■■■ 5.48
IFT140Q96RY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
IFT140Q96RY7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC49.26■■■■■ 5.48
IFT140Q96RY7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
IFT140Q96RY7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
IFT140Q96RY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
IFT140Q96RY7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
IFT140Q96RY7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
IFT140Q96RY7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
IFT140Q96RY7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
IFT140Q96RY7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
IFT140Q96RY7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.03■■■■■ 5.44
IFT140Q96RY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
IFT140Q96RY7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.44
IFT140Q96RY7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC49■■■■■ 5.44
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
IFT140Q96RY7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
IFT140Q96RY7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
IFT140Q96RY7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
IFT140Q96RY7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
IFT140Q96RY7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
IFT140Q96RY7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
IFT140Q96RY7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
IFT140Q96RY7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
IFT140Q96RY7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.76■■■■■ 5.4
IFT140Q96RY7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.4
IFT140Q96RY7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
IFT140Q96RY7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
IFT140Q96RY7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
IFT140Q96RY7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
IFT140Q96RY7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
IFT140Q96RY7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC48.65■■■■■ 5.38
IFT140Q96RY7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
IFT140Q96RY7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC48.65■■■■■ 5.38
IFT140Q96RY7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
IFT140Q96RY7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
IFT140Q96RY7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
IFT140Q96RY7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC48.57■■■■■ 5.37
IFT140Q96RY7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
IFT140Q96RY7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
IFT140Q96RY7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.35
IFT140Q96RY7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
IFT140Q96RY7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
IFT140Q96RY7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
IFT140Q96RY7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
IFT140Q96RY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
IFT140Q96RY7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
IFT140Q96RY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms