Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSNARE1Q96NA8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TSNARE1Q96NA8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSNARE1Q96NA8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSNARE1Q96NA8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSNARE1Q96NA8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSNARE1Q96NA8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSNARE1Q96NA8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSNARE1Q96NA8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSNARE1Q96NA8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSNARE1Q96NA8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSNARE1Q96NA8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1Q96NA8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSNARE1Q96NA8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSNARE1Q96NA8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSNARE1Q96NA8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1Q96NA8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSNARE1Q96NA8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSNARE1Q96NA8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1Q96NA8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSNARE1Q96NA8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1Q96NA8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1Q96NA8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSNARE1Q96NA8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSNARE1Q96NA8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSNARE1Q96NA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSNARE1Q96NA8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSNARE1Q96NA8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSNARE1Q96NA8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms