Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01600Q96MT4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01600Q96MT4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01600Q96MT4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01600Q96MT4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01600Q96MT4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC01600Q96MT4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01600Q96MT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01600Q96MT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01600Q96MT4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01600Q96MT4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01600Q96MT4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01600Q96MT4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01600Q96MT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01600Q96MT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms