Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC114Q96M63 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC114Q96M63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC114Q96M63 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC114Q96M63 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC114Q96M63 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC114Q96M63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC114Q96M63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC114Q96M63 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC114Q96M63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC114Q96M63 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC114Q96M63 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC114Q96M63 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC114Q96M63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC114Q96M63 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC114Q96M63 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC114Q96M63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC114Q96M63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC114Q96M63 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC114Q96M63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC114Q96M63 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC114Q96M63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC114Q96M63 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC114Q96M63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC114Q96M63 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC114Q96M63 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC114Q96M63 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC114Q96M63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC114Q96M63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC114Q96M63 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC114Q96M63 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC114Q96M63 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms