Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf48Q96LS8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf48Q96LS8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf48Q96LS8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C2orf48Q96LS8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf48Q96LS8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf48Q96LS8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf48Q96LS8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf48Q96LS8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf48Q96LS8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf48Q96LS8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf48Q96LS8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C2orf48Q96LS8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf48Q96LS8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf48Q96LS8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf48Q96LS8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C2orf48Q96LS8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf48Q96LS8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf48Q96LS8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C2orf48Q96LS8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2orf48Q96LS8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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