Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAC1Q96KF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PRAC1Q96KF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PRAC1Q96KF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PRAC1Q96KF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRAC1Q96KF2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PRAC1Q96KF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PRAC1Q96KF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRAC1Q96KF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAC1Q96KF2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PRAC1Q96KF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRAC1Q96KF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PRAC1Q96KF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms