Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SUCLG2Q96I99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SUCLG2Q96I99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SUCLG2Q96I99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUCLG2Q96I99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUCLG2Q96I99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUCLG2Q96I99 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SUCLG2Q96I99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SUCLG2Q96I99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUCLG2Q96I99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUCLG2Q96I99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SUCLG2Q96I99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SUCLG2Q96I99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SUCLG2Q96I99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SUCLG2Q96I99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SUCLG2Q96I99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SUCLG2Q96I99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SUCLG2Q96I99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUCLG2Q96I99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUCLG2Q96I99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUCLG2Q96I99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUCLG2Q96I99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUCLG2Q96I99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUCLG2Q96I99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUCLG2Q96I99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUCLG2Q96I99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUCLG2Q96I99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SUCLG2Q96I99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SUCLG2Q96I99 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SUCLG2Q96I99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SUCLG2Q96I99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SUCLG2Q96I99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SUCLG2Q96I99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SUCLG2Q96I99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SUCLG2Q96I99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SUCLG2Q96I99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SUCLG2Q96I99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SUCLG2Q96I99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SUCLG2Q96I99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SUCLG2Q96I99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SUCLG2Q96I99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SUCLG2Q96I99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SUCLG2Q96I99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SUCLG2Q96I99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SUCLG2Q96I99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SUCLG2Q96I99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SUCLG2Q96I99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SUCLG2Q96I99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SUCLG2Q96I99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SUCLG2Q96I99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SUCLG2Q96I99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SUCLG2Q96I99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SUCLG2Q96I99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SUCLG2Q96I99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SUCLG2Q96I99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SUCLG2Q96I99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SUCLG2Q96I99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUCLG2Q96I99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SUCLG2Q96I99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SUCLG2Q96I99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SUCLG2Q96I99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SUCLG2Q96I99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUCLG2Q96I99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUCLG2Q96I99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUCLG2Q96I99 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SUCLG2Q96I99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SUCLG2Q96I99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms