Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATXN7L3BQ96GX2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN7L3BQ96GX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN7L3BQ96GX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATXN7L3BQ96GX2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN7L3BQ96GX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATXN7L3BQ96GX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATXN7L3BQ96GX2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN7L3BQ96GX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN7L3BQ96GX2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN7L3BQ96GX2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN7L3BQ96GX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATXN7L3BQ96GX2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATXN7L3BQ96GX2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN7L3BQ96GX2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN7L3BQ96GX2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATXN7L3BQ96GX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATXN7L3BQ96GX2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN7L3BQ96GX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN7L3BQ96GX2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATXN7L3BQ96GX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATXN7L3BQ96GX2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN7L3BQ96GX2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATXN7L3BQ96GX2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATXN7L3BQ96GX2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN7L3BQ96GX2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms