Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDCA7LQ96GN5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDCA7LQ96GN5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CDCA7LQ96GN5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDCA7LQ96GN5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDCA7LQ96GN5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDCA7LQ96GN5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDCA7LQ96GN5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDCA7LQ96GN5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDCA7LQ96GN5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDCA7LQ96GN5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDCA7LQ96GN5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDCA7LQ96GN5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDCA7LQ96GN5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDCA7LQ96GN5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDCA7LQ96GN5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CDCA7LQ96GN5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDCA7LQ96GN5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDCA7LQ96GN5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDCA7LQ96GN5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDCA7LQ96GN5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDCA7LQ96GN5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDCA7LQ96GN5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDCA7LQ96GN5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDCA7LQ96GN5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CDCA7LQ96GN5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CDCA7LQ96GN5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDCA7LQ96GN5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDCA7LQ96GN5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CDCA7LQ96GN5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CDCA7LQ96GN5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDCA7LQ96GN5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CDCA7LQ96GN5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDCA7LQ96GN5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDCA7LQ96GN5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDCA7LQ96GN5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CDCA7LQ96GN5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDCA7LQ96GN5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDCA7LQ96GN5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDCA7LQ96GN5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CDCA7LQ96GN5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CDCA7LQ96GN5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CDCA7LQ96GN5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CDCA7LQ96GN5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDCA7LQ96GN5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDCA7LQ96GN5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDCA7LQ96GN5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CDCA7LQ96GN5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CDCA7LQ96GN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDCA7LQ96GN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDCA7LQ96GN5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDCA7LQ96GN5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDCA7LQ96GN5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDCA7LQ96GN5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDCA7LQ96GN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA7LQ96GN5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA7LQ96GN5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA7LQ96GN5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA7LQ96GN5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDCA7LQ96GN5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms