Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL48Q96GC5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL48Q96GC5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL48Q96GC5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL48Q96GC5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL48Q96GC5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL48Q96GC5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL48Q96GC5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL48Q96GC5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL48Q96GC5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL48Q96GC5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL48Q96GC5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL48Q96GC5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL48Q96GC5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL48Q96GC5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL48Q96GC5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL48Q96GC5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL48Q96GC5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL48Q96GC5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL48Q96GC5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL48Q96GC5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL48Q96GC5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL48Q96GC5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms