Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRAMD1AQ96CP6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRAMD1AQ96CP6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRAMD1AQ96CP6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRAMD1AQ96CP6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRAMD1AQ96CP6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRAMD1AQ96CP6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1AQ96CP6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRAMD1AQ96CP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRAMD1AQ96CP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRAMD1AQ96CP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRAMD1AQ96CP6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRAMD1AQ96CP6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRAMD1AQ96CP6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRAMD1AQ96CP6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRAMD1AQ96CP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRAMD1AQ96CP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRAMD1AQ96CP6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRAMD1AQ96CP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRAMD1AQ96CP6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRAMD1AQ96CP6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRAMD1AQ96CP6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1AQ96CP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1AQ96CP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRAMD1AQ96CP6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRAMD1AQ96CP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms