Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4CQ96CF2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHMP4CQ96CF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMP4CQ96CF2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMP4CQ96CF2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHMP4CQ96CF2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CHMP4CQ96CF2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHMP4CQ96CF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMP4CQ96CF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMP4CQ96CF2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHMP4CQ96CF2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHMP4CQ96CF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHMP4CQ96CF2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHMP4CQ96CF2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHMP4CQ96CF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHMP4CQ96CF2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMP4CQ96CF2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHMP4CQ96CF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHMP4CQ96CF2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHMP4CQ96CF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHMP4CQ96CF2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHMP4CQ96CF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHMP4CQ96CF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHMP4CQ96CF2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHMP4CQ96CF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHMP4CQ96CF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHMP4CQ96CF2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHMP4CQ96CF2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4CQ96CF2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4CQ96CF2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4CQ96CF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHMP4CQ96CF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHMP4CQ96CF2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHMP4CQ96CF2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHMP4CQ96CF2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHMP4CQ96CF2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHMP4CQ96CF2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4CQ96CF2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4CQ96CF2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMP4CQ96CF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHMP4CQ96CF2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHMP4CQ96CF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHMP4CQ96CF2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHMP4CQ96CF2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHMP4CQ96CF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHMP4CQ96CF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHMP4CQ96CF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms