Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF25Q96BH1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF25Q96BH1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF25Q96BH1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF25Q96BH1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF25Q96BH1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF25Q96BH1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF25Q96BH1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF25Q96BH1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF25Q96BH1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF25Q96BH1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF25Q96BH1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF25Q96BH1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF25Q96BH1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF25Q96BH1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF25Q96BH1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF25Q96BH1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF25Q96BH1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF25Q96BH1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF25Q96BH1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF25Q96BH1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF25Q96BH1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF25Q96BH1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF25Q96BH1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF25Q96BH1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF25Q96BH1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF25Q96BH1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF25Q96BH1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF25Q96BH1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF25Q96BH1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF25Q96BH1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF25Q96BH1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF25Q96BH1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF25Q96BH1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF25Q96BH1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF25Q96BH1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF25Q96BH1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF25Q96BH1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF25Q96BH1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF25Q96BH1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF25Q96BH1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms