Protein–RNA interactions for Protein: Q96A08

HIST1H2BA, Histone H2B type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2BAQ96A08 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2BAQ96A08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2BAQ96A08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2BAQ96A08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2BAQ96A08 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST1H2BAQ96A08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H2BAQ96A08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H2BAQ96A08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2BAQ96A08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2BAQ96A08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H2BAQ96A08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST1H2BAQ96A08 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2BAQ96A08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2BAQ96A08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST1H2BAQ96A08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H2BAQ96A08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST1H2BAQ96A08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2BAQ96A08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H2BAQ96A08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H2BAQ96A08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2BAQ96A08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H2BAQ96A08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H2BAQ96A08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H2BAQ96A08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H2BAQ96A08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2BAQ96A08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2BAQ96A08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2BAQ96A08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms