Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNPO1Q92973 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNPO1Q92973 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNPO1Q92973 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNPO1Q92973 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNPO1Q92973 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNPO1Q92973 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNPO1Q92973 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNPO1Q92973 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNPO1Q92973 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNPO1Q92973 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TNPO1Q92973 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNPO1Q92973 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNPO1Q92973 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNPO1Q92973 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNPO1Q92973 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNPO1Q92973 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TNPO1Q92973 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNPO1Q92973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNPO1Q92973 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNPO1Q92973 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TNPO1Q92973 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNPO1Q92973 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNPO1Q92973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNPO1Q92973 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNPO1Q92973 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TNPO1Q92973 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNPO1Q92973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNPO1Q92973 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNPO1Q92973 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNPO1Q92973 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNPO1Q92973 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNPO1Q92973 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNPO1Q92973 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNPO1Q92973 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNPO1Q92973 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNPO1Q92973 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNPO1Q92973 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNPO1Q92973 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNPO1Q92973 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNPO1Q92973 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNPO1Q92973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNPO1Q92973 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNPO1Q92973 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNPO1Q92973 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNPO1Q92973 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNPO1Q92973 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms