Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIT1Q92963 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIT1Q92963 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIT1Q92963 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIT1Q92963 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIT1Q92963 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIT1Q92963 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIT1Q92963 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIT1Q92963 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIT1Q92963 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIT1Q92963 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIT1Q92963 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIT1Q92963 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIT1Q92963 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIT1Q92963 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT1Q92963 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIT1Q92963 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIT1Q92963 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIT1Q92963 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIT1Q92963 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIT1Q92963 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIT1Q92963 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIT1Q92963 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIT1Q92963 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIT1Q92963 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIT1Q92963 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIT1Q92963 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIT1Q92963 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIT1Q92963 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIT1Q92963 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIT1Q92963 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RIT1Q92963 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIT1Q92963 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIT1Q92963 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms