Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KIFAP3Q92845 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KIFAP3Q92845 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KIFAP3Q92845 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KIFAP3Q92845 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIFAP3Q92845 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIFAP3Q92845 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KIFAP3Q92845 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIFAP3Q92845 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KIFAP3Q92845 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIFAP3Q92845 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KIFAP3Q92845 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIFAP3Q92845 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
KIFAP3Q92845 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIFAP3Q92845 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIFAP3Q92845 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIFAP3Q92845 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIFAP3Q92845 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIFAP3Q92845 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIFAP3Q92845 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIFAP3Q92845 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIFAP3Q92845 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIFAP3Q92845 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIFAP3Q92845 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIFAP3Q92845 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIFAP3Q92845 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIFAP3Q92845 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIFAP3Q92845 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIFAP3Q92845 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIFAP3Q92845 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIFAP3Q92845 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIFAP3Q92845 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIFAP3Q92845 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIFAP3Q92845 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIFAP3Q92845 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIFAP3Q92845 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIFAP3Q92845 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIFAP3Q92845 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
KIFAP3Q92845 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIFAP3Q92845 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms