Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDAQ92838 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDAQ92838 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EDAQ92838 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDAQ92838 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
EDAQ92838 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EDAQ92838 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
EDAQ92838 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EDAQ92838 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
EDAQ92838 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDAQ92838 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EDAQ92838 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EDAQ92838 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EDAQ92838 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EDAQ92838 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EDAQ92838 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
EDAQ92838 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EDAQ92838 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDAQ92838 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDAQ92838 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
EDAQ92838 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDAQ92838 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDAQ92838 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDAQ92838 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDAQ92838 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDAQ92838 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EDAQ92838 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EDAQ92838 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EDAQ92838 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EDAQ92838 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDAQ92838 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDAQ92838 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDAQ92838 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDAQ92838 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
EDAQ92838 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDAQ92838 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDAQ92838 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDAQ92838 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDAQ92838 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDAQ92838 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDAQ92838 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDAQ92838 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDAQ92838 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDAQ92838 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EDAQ92838 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EDAQ92838 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EDAQ92838 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDAQ92838 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EDAQ92838 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EDAQ92838 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EDAQ92838 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDAQ92838 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDAQ92838 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDAQ92838 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDAQ92838 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EDAQ92838 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EDAQ92838 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EDAQ92838 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EDAQ92838 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDAQ92838 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EDAQ92838 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EDAQ92838 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDAQ92838 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDAQ92838 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EDAQ92838 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EDAQ92838 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EDAQ92838 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDAQ92838 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDAQ92838 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDAQ92838 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDAQ92838 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EDAQ92838 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDAQ92838 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDAQ92838 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDAQ92838 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDAQ92838 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDAQ92838 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDAQ92838 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDAQ92838 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDAQ92838 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDAQ92838 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDAQ92838 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDAQ92838 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDAQ92838 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDAQ92838 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDAQ92838 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDAQ92838 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDAQ92838 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EDAQ92838 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDAQ92838 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDAQ92838 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDAQ92838 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDAQ92838 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EDAQ92838 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EDAQ92838 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EDAQ92838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EDAQ92838 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDAQ92838 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDAQ92838 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDAQ92838 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms