Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRUB1Q8WWH5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRUB1Q8WWH5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRUB1Q8WWH5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB1Q8WWH5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB1Q8WWH5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB1Q8WWH5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB1Q8WWH5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB1Q8WWH5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB1Q8WWH5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRUB1Q8WWH5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRUB1Q8WWH5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB1Q8WWH5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRUB1Q8WWH5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRUB1Q8WWH5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB1Q8WWH5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB1Q8WWH5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB1Q8WWH5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB1Q8WWH5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB1Q8WWH5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRUB1Q8WWH5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB1Q8WWH5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB1Q8WWH5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB1Q8WWH5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB1Q8WWH5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRUB1Q8WWH5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRUB1Q8WWH5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRUB1Q8WWH5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRUB1Q8WWH5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRUB1Q8WWH5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRUB1Q8WWH5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRUB1Q8WWH5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRUB1Q8WWH5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRUB1Q8WWH5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRUB1Q8WWH5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRUB1Q8WWH5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms