Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF4Q8WWF5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF4Q8WWF5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF4Q8WWF5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF4Q8WWF5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF4Q8WWF5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF4Q8WWF5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF4Q8WWF5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF4Q8WWF5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF4Q8WWF5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF4Q8WWF5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF4Q8WWF5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF4Q8WWF5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF4Q8WWF5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF4Q8WWF5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF4Q8WWF5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF4Q8WWF5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNRF4Q8WWF5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNRF4Q8WWF5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF4Q8WWF5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF4Q8WWF5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF4Q8WWF5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF4Q8WWF5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF4Q8WWF5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF4Q8WWF5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF4Q8WWF5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF4Q8WWF5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms