Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC13Q8WW36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC13Q8WW36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZCCHC13Q8WW36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC13Q8WW36 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZCCHC13Q8WW36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC13Q8WW36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC13Q8WW36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC13Q8WW36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC13Q8WW36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC13Q8WW36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC13Q8WW36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms