Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARB1Q8WTV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARB1Q8WTV0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARB1Q8WTV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB1Q8WTV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARB1Q8WTV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARB1Q8WTV0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARB1Q8WTV0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARB1Q8WTV0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARB1Q8WTV0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARB1Q8WTV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARB1Q8WTV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARB1Q8WTV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARB1Q8WTV0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARB1Q8WTV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARB1Q8WTV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARB1Q8WTV0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARB1Q8WTV0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARB1Q8WTV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARB1Q8WTV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARB1Q8WTV0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARB1Q8WTV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARB1Q8WTV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARB1Q8WTV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARB1Q8WTV0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB1Q8WTV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARB1Q8WTV0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARB1Q8WTV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARB1Q8WTV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms