Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAM71BQ8TC56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAM71BQ8TC56 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FAM71BQ8TC56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAM71BQ8TC56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM71BQ8TC56 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM71BQ8TC56 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAM71BQ8TC56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAM71BQ8TC56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM71BQ8TC56 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAM71BQ8TC56 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FAM71BQ8TC56 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAM71BQ8TC56 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FAM71BQ8TC56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FAM71BQ8TC56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FAM71BQ8TC56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FAM71BQ8TC56 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FAM71BQ8TC56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FAM71BQ8TC56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAM71BQ8TC56 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAM71BQ8TC56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAM71BQ8TC56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAM71BQ8TC56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM71BQ8TC56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM71BQ8TC56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM71BQ8TC56 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM71BQ8TC56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM71BQ8TC56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM71BQ8TC56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM71BQ8TC56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM71BQ8TC56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM71BQ8TC56 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM71BQ8TC56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM71BQ8TC56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM71BQ8TC56 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM71BQ8TC56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM71BQ8TC56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM71BQ8TC56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM71BQ8TC56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM71BQ8TC56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM71BQ8TC56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM71BQ8TC56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM71BQ8TC56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM71BQ8TC56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FAM71BQ8TC56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM71BQ8TC56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM71BQ8TC56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM71BQ8TC56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM71BQ8TC56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM71BQ8TC56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM71BQ8TC56 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM71BQ8TC56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms