Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFP28Q8NHY6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFP28Q8NHY6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFP28Q8NHY6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFP28Q8NHY6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFP28Q8NHY6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFP28Q8NHY6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZFP28Q8NHY6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZFP28Q8NHY6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZFP28Q8NHY6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFP28Q8NHY6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFP28Q8NHY6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFP28Q8NHY6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFP28Q8NHY6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZFP28Q8NHY6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFP28Q8NHY6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFP28Q8NHY6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFP28Q8NHY6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFP28Q8NHY6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFP28Q8NHY6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFP28Q8NHY6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZFP28Q8NHY6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZFP28Q8NHY6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFP28Q8NHY6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZFP28Q8NHY6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZFP28Q8NHY6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFP28Q8NHY6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFP28Q8NHY6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFP28Q8NHY6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZFP28Q8NHY6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZFP28Q8NHY6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZFP28Q8NHY6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFP28Q8NHY6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFP28Q8NHY6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZFP28Q8NHY6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFP28Q8NHY6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZFP28Q8NHY6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZFP28Q8NHY6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZFP28Q8NHY6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZFP28Q8NHY6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZFP28Q8NHY6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZFP28Q8NHY6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms