Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGA8

OR4F17, Olfactory receptor 4F17, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR4F17Q8NGA8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OR4F17Q8NGA8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OR4F17Q8NGA8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OR4F17Q8NGA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OR4F17Q8NGA8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OR4F17Q8NGA8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OR4F17Q8NGA8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OR4F17Q8NGA8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OR4F17Q8NGA8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OR4F17Q8NGA8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OR4F17Q8NGA8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OR4F17Q8NGA8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OR4F17Q8NGA8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OR4F17Q8NGA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OR4F17Q8NGA8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OR4F17Q8NGA8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR4F17Q8NGA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OR4F17Q8NGA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OR4F17Q8NGA8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OR4F17Q8NGA8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OR4F17Q8NGA8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OR4F17Q8NGA8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OR4F17Q8NGA8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OR4F17Q8NGA8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OR4F17Q8NGA8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OR4F17Q8NGA8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OR4F17Q8NGA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OR4F17Q8NGA8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR4F17Q8NGA8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR4F17Q8NGA8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OR4F17Q8NGA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OR4F17Q8NGA8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR4F17Q8NGA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR4F17Q8NGA8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms