Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF397Q8NF99 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF397Q8NF99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF397Q8NF99 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF397Q8NF99 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF397Q8NF99 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF397Q8NF99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF397Q8NF99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF397Q8NF99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF397Q8NF99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZNF397Q8NF99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF397Q8NF99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF397Q8NF99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF397Q8NF99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF397Q8NF99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF397Q8NF99 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF397Q8NF99 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF397Q8NF99 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF397Q8NF99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF397Q8NF99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF397Q8NF99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF397Q8NF99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF397Q8NF99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF397Q8NF99 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNF397Q8NF99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF397Q8NF99 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF397Q8NF99 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNF397Q8NF99 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF397Q8NF99 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF397Q8NF99 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZNF397Q8NF99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF397Q8NF99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF397Q8NF99 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF397Q8NF99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF397Q8NF99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF397Q8NF99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNF397Q8NF99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNF397Q8NF99 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNF397Q8NF99 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNF397Q8NF99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNF397Q8NF99 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF397Q8NF99 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZNF397Q8NF99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF397Q8NF99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ZNF397Q8NF99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF397Q8NF99 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNF397Q8NF99 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNF397Q8NF99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms