Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACVR1CQ8NER5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACVR1CQ8NER5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACVR1CQ8NER5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACVR1CQ8NER5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACVR1CQ8NER5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACVR1CQ8NER5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACVR1CQ8NER5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACVR1CQ8NER5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACVR1CQ8NER5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACVR1CQ8NER5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACVR1CQ8NER5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACVR1CQ8NER5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACVR1CQ8NER5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ACVR1CQ8NER5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACVR1CQ8NER5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACVR1CQ8NER5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACVR1CQ8NER5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACVR1CQ8NER5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACVR1CQ8NER5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACVR1CQ8NER5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACVR1CQ8NER5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACVR1CQ8NER5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACVR1CQ8NER5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACVR1CQ8NER5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACVR1CQ8NER5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACVR1CQ8NER5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACVR1CQ8NER5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACVR1CQ8NER5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACVR1CQ8NER5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms