Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE71

ABCF1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF1Q8NE71 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 423.3■■□□□ 1.323e-11■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 521.45■■□□□ 1.023e-11■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.943e-11■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 317.21■□□□□ 0.353e-11■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.1
ABCF1Q8NE71 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 221.72■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 23
ABCF1Q8NE71 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 23
ABCF1Q8NE71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.379e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 235.68■■■■□ 3.39e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 235.04■■■■□ 3.29e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 STK11-208ENST00000591133 1011 ntTSL 228.7■■■□□ 2.189e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.879e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 323.86■■□□□ 1.419e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.399e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.349e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 STK11-206ENST00000586358 770 ntTSL 522.28■■□□□ 1.169e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.569e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 218.25■□□□□ 0.519e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 412.5□□□□□ -0.419e-6■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 22.7
ABCF1Q8NE71 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.1
ABCF1Q8NE71 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-6■■■■□ 22.1
ABCF1Q8NE71 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 22.1
ABCF1Q8NE71 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 22.1
ABCF1Q8NE71 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 22.1
ABCF1Q8NE71 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.92e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)28.26■■■□□ 2.112e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 327.43■■□□□ 1.982e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 224.31■■□□□ 1.482e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.252e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)21.68■■□□□ 1.062e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.872e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.242e-10■■■■□ 20.6
ABCF1Q8NE71 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 330.45■■■□□ 2.476e-7■■■■□ 19.8
ABCF1Q8NE71 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt26.71■■□□□ 1.876e-7■■■■□ 19.8
ABCF1Q8NE71 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 217.36■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 19.7
ABCF1Q8NE71 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.148e-7■■■■□ 19.6
ABCF1Q8NE71 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.038e-7■■■■□ 19.6
ABCF1Q8NE71 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.828e-7■■■■□ 19.6
ABCF1Q8NE71 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.14e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 525.36■■□□□ 1.654e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.644e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 225.05■■□□□ 1.64e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 224.23■■□□□ 1.474e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 223.69■■□□□ 1.384e-7■■■■□ 19.3
ABCF1Q8NE71 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.98□□□□□ -1.617e-8■■■□□ 19.2
ABCF1Q8NE71 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.543e-6■■■□□ 19
ABCF1Q8NE71 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.51e-6■■■□□ 18.9
ABCF1Q8NE71 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.361e-6■■■□□ 18.9
ABCF1Q8NE71 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 18.9
ABCF1Q8NE71 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 18.9
ABCF1Q8NE71 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 312.98□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 18.9
ABCF1Q8NE71 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.072e-6■■■□□ 18.4
ABCF1Q8NE71 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 527.39■■□□□ 1.982e-6■■■□□ 18.4
ABCF1Q8NE71 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.812e-6■■■□□ 18.4
ABCF1Q8NE71 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 525.41■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 18.4
ABCF1Q8NE71 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.482e-6■■■□□ 18.4
ABCF1Q8NE71 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 325.82■■□□□ 1.729e-7■■■□□ 18.1
ABCF1Q8NE71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.362e-6■■■□□ 18.1
ABCF1Q8NE71 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.811e-6■■■□□ 18
ABCF1Q8NE71 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 321.21■□□□□ 0.992e-11■■■□□ 17.9
ABCF1Q8NE71 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-11■■■□□ 17.9
ABCF1Q8NE71 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.165e-8■■■□□ 17.8
ABCF1Q8NE71 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.845e-8■■■□□ 17.8
ABCF1Q8NE71 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.255e-8■■■□□ 17.8
ABCF1Q8NE71 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 24.78□□□□□ -1.641e-8■■■□□ 17.3
ABCF1Q8NE71 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-11■■■□□ 17.3
ABCF1Q8NE71 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-11■■■□□ 17.3
ABCF1Q8NE71 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 420.97■□□□□ 0.952e-11■■■□□ 17.3
ABCF1Q8NE71 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.254e-6■■■□□ 17.1
ABCF1Q8NE71 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-6■■■□□ 17.1
ABCF1Q8NE71 FBXL19-206ENST00000562798 299 ntTSL 427■■□□□ 1.915e-6■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.841e-7■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.771e-7■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.835e-6■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-6■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 213.43□□□□□ -0.267e-23■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 212.6□□□□□ -0.397e-23■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.757e-23■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 59.26□□□□□ -0.937e-23■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.07□□□□□ -1.927e-23■■■□□ 17
ABCF1Q8NE71 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 518.53■□□□□ 0.564e-6■■■□□ 16.6
ABCF1Q8NE71 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 16.6
ABCF1Q8NE71 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 16.6
ABCF1Q8NE71 TBRG4-214ENST00000488222 972 ntTSL 326.05■■□□□ 1.763e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.353e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 222.61■■□□□ 1.213e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-213ENST00000484326 835 ntTSL 222.61■■□□□ 1.213e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.23e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.023e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-209ENST00000478532 945 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.13e-32■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 525.71■■□□□ 1.717e-8■■■□□ 16.5
ABCF1Q8NE71 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 324.06■■□□□ 1.447e-8■■■□□ 16.5
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