Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC89Q8N998 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC89Q8N998 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC89Q8N998 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC89Q8N998 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC89Q8N998 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC89Q8N998 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC89Q8N998 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC89Q8N998 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC89Q8N998 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC89Q8N998 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC89Q8N998 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC89Q8N998 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC89Q8N998 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC89Q8N998 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC89Q8N998 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC89Q8N998 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC89Q8N998 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC89Q8N998 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC89Q8N998 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC89Q8N998 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC89Q8N998 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC89Q8N998 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC89Q8N998 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC89Q8N998 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC89Q8N998 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC89Q8N998 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC89Q8N998 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC89Q8N998 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC89Q8N998 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC89Q8N998 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC89Q8N998 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC89Q8N998 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms