Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSGALNACT2Q8N6G5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CSGALNACT2Q8N6G5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CSGALNACT2Q8N6G5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CSGALNACT2Q8N6G5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSGALNACT2Q8N6G5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CSGALNACT2Q8N6G5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CSGALNACT2Q8N6G5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CSGALNACT2Q8N6G5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CSGALNACT2Q8N6G5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CSGALNACT2Q8N6G5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CSGALNACT2Q8N6G5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CSGALNACT2Q8N6G5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSGALNACT2Q8N6G5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms